শাংহাই সহযোগিতা সংস্থার প্রধান সচিব হয়েছেন ইরকুত্স্ক প্রদেশের প্রাক্তন গভর্নর দমিত্রি মেজেন্তসেভ. বৃহস্পতিবার বেজিং শীর্ষ সাক্ষাতের ফলাফল সংক্রান্ত খবরে আরও জানানো হয়েছে যে, শাংহাই সহযোগিতা সংস্থার আঞ্চলিক সন্ত্রাসবিরোধী বিন্যাসের কার্যনির্বাহী কমিটির ডিরেক্টর হয়েছেন চীনের প্রতিনিধি জান সিনফেন. তাঁরা এ পদে অধিষ্ঠিত থাকবেন ২০১৩ সালের ১লা জানুয়ারী থেকে ২০১৫ সালের ৩১শে ডিসেম্বর অবধি. বেজিং শীর্ষ সাক্ষাতে চীন শাংহাই সহযোগিতা সংস্থার সভাপতিত্ব হস্তান্তর করেছে কির্গিজিয়া-কে, যেখানে পরবর্তী শীর্ষ সাক্ষাত্ অনুষ্ঠিত হবে.